21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56382 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  43.48 
 
 
381 aa  195  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08270  conserved hypothetical protein  38.55 
 
 
380 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  25.58 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  26.94 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  26.98 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  25.82 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  24.34 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  24.19 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  24.31 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  25.45 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  24.77 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  25.95 
 
 
237 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  30.81 
 
 
410 aa  48.5  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  24.56 
 
 
387 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  26.57 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45453  predicted protein  26.03 
 
 
458 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00124507  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  26.51 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  25.58 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  25.33 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  23.72 
 
 
237 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>