40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2359 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  87.34 
 
 
237 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  83.97 
 
 
237 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  72.22 
 
 
237 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  78.37 
 
 
227 aa  352  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  34.95 
 
 
719 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
275 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  30.42 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  34.8 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  29.91 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  26.67 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  27.14 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  26.39 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  30.39 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  26.2 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  25.93 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  28.87 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  29.59 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  27.14 
 
 
444 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  26.49 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  28.65 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  29.53 
 
 
244 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  27.94 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  27.6 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  31.33 
 
 
387 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  24.75 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  25.95 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  26.56 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.66 
 
 
509 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  28.57 
 
 
1011 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3113  hypothetical protein  27.4 
 
 
298 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0147985 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  45.4  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  29.17 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  34.38 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.12 
 
 
525 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  31.08 
 
 
562 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  26.09 
 
 
526 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  24.87 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>