35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0500 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  66.67 
 
 
269 aa  274  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  63.86 
 
 
218 aa  272  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  67.66 
 
 
206 aa  267  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  68.63 
 
 
226 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  60.1 
 
 
223 aa  251  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  57.28 
 
 
220 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  30.81 
 
 
230 aa  82  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  31.86 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  31.25 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  29.61 
 
 
410 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  24.19 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3714  hypothetical protein  27.14 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  26.91 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  26.46 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  28.22 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  27.23 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  25.79 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  27.31 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  26.49 
 
 
381 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  27.94 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  27.36 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
237 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.04 
 
 
244 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1986  dolichol kinase-like protein  27.07 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00109651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  30.15 
 
 
237 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0763  phosphatidate cytidylyltransferase  36.47 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  26.87 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
259 aa  42  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  28.24 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>