49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4221 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  69.57 
 
 
236 aa  327  9e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  61.57 
 
 
244 aa  290  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  56.25 
 
 
227 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  55 
 
 
232 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  53.95 
 
 
225 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  53.49 
 
 
225 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  55.34 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  38.34 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  34.43 
 
 
213 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  32.71 
 
 
213 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  37.56 
 
 
217 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  36.65 
 
 
213 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  38.25 
 
 
223 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  36.32 
 
 
216 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  41.08 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  38.95 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  36.02 
 
 
237 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  38.62 
 
 
147 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  31.11 
 
 
234 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  29.6 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  27.71 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.05 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  26.67 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 
444 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  27.68 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  25.97 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  27.23 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  37.61 
 
 
521 aa  52.4  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  26.34 
 
 
227 aa  52  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  34.34 
 
 
719 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  26.67 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  22.51 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  35.85 
 
 
226 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  35.29 
 
 
198 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  25.23 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.91 
 
 
525 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  37.37 
 
 
509 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  25.12 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  29.63 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.27 
 
 
526 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  30.93 
 
 
562 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
197 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>