39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1951 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
444 aa  867    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  31.31 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  31.38 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  29.65 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
232 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  25.93 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  28 
 
 
237 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 
244 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  28.14 
 
 
237 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  27.48 
 
 
217 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  29.86 
 
 
269 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  29.67 
 
 
195 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  26.92 
 
 
227 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  28.18 
 
 
225 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  27.73 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  30.11 
 
 
217 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
237 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  26.56 
 
 
213 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  29.57 
 
 
217 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  27.57 
 
 
213 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  27.72 
 
 
216 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  25.86 
 
 
234 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  26.63 
 
 
237 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  24.86 
 
 
526 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  26.7 
 
 
213 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  28.14 
 
 
223 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  27.32 
 
 
223 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  35.61 
 
 
198 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  26.77 
 
 
220 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  21.9 
 
 
525 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  25.13 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  25.39 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3113  hypothetical protein  27.34 
 
 
298 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0147985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  26.96 
 
 
526 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  23.98 
 
 
275 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.6 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.55 
 
 
516 aa  43.5  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  26.19 
 
 
211 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>