21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0030 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  27.31 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  28.25 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  28.31 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  27.68 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.23 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  29.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  26.32 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  28.64 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.62 
 
 		 516 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  26.42 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.26 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.98 
 
 		 509 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  32.29 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  34.38 
 
 		 526 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  30.69 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  25.12 
 
 		 562 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  29.17 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>