52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4889 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4889  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  864    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1296  protein of unknown function DUF1063  79.06 
 
 		 424 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.351062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3223  hypothetical protein  79.06 
 
 		 424 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.654811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3080  hypothetical protein  79.06 
 
 		 424 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3070  hypothetical protein  79.06 
 
 		 424 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2972  hypothetical protein  77.59 
 
 		 424 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1403  hypothetical protein  76.89 
 
 		 424 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2793  hypothetical protein  76.65 
 
 		 424 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2876  hypothetical protein  76.65 
 
 		 424 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1209  hypothetical protein  76.18 
 
 		 424 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03081  hypothetical protein  64.94 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2537  hypothetical protein  69.65 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.518333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002893  putative inner membrane protein  65.88 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0741  hypothetical protein  64.55 
 
 		 425 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0593  protein of unknown function DUF1063  48.17 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3406  hypothetical protein  48.17 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4423  hypothetical protein  48.49 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0648812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3584  hypothetical protein  47.94 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02977  hypothetical protein  47.94 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0588  hypothetical protein  47.94 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3298  hypothetical protein  47.94 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02928  hypothetical protein  47.94 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3249  hypothetical protein  47.71 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3429  hypothetical protein  46.15 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.825866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3596  putative inner membrane protein  46.15 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.062569  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3500  hypothetical protein  45.92 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3426  putative inner membrane protein  45.92 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3533  hypothetical protein  45.92 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.387647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0807  hypothetical protein  44.81 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0809  hypothetical protein  45.31 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2155  protein of unknown function DUF1063  42.92 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0909  hypothetical protein  39.63 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2144  hypothetical protein  37.7 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0803  hypothetical protein  39.47 
 
 		 427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0790  hypothetical protein  39 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1256  hypothetical protein  37.79 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000902575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2196  protein of unknown function DUF1063  36.79 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1231  protein of unknown function DUF1063  34.12 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000111726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1844  protein of unknown function DUF1063  34.89 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0487  protein of unknown function DUF1063  35.54 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17397 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1007  hypothetical protein  32.21 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0321  protein of unknown function DUF1063  31.09 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1527  hypothetical protein  32.7 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.844759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0502  protein of unknown function DUF1063  35.15 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.264591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0811  hypothetical protein  30.14 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000789442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1488  protein of unknown function DUF1063  32.41 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2496  hypothetical protein  32.26 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1414  hypothetical protein  30.27 
 
 		 425 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000941621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1278  hypothetical protein  29.86 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1205  hypothetical protein  28.1 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0921136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0110  hypothetical protein  26.87 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0713  hypothetical protein  26.78 
 
 		 397 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>