52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2793 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3080  hypothetical protein  89.6 
 
 		 424 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1209  hypothetical protein  90.07 
 
 		 424 aa  732    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3070  hypothetical protein  89.6 
 
 		 424 aa  727    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1296  protein of unknown function DUF1063  89.36 
 
 		 424 aa  726    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.351062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1403  hypothetical protein  95.75 
 
 		 424 aa  773    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3223  hypothetical protein  89.6 
 
 		 424 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.654811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2972  hypothetical protein  97.64 
 
 		 424 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2876  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  860    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2793  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  860    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4889  hypothetical protein  76.65 
 
 		 425 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03081  hypothetical protein  66.51 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002893  putative inner membrane protein  66.04 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2537  hypothetical protein  66.43 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.518333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0741  hypothetical protein  64.39 
 
 		 425 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3406  hypothetical protein  47.78 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0588  hypothetical protein  47.78 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02977  hypothetical protein  47.78 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02928  hypothetical protein  47.78 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0593  protein of unknown function DUF1063  47.78 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3298  hypothetical protein  47.78 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3584  hypothetical protein  47.54 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4423  hypothetical protein  47.54 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0648812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3249  hypothetical protein  47.31 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3596  putative inner membrane protein  46.84 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.062569  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3426  putative inner membrane protein  46.6 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3533  hypothetical protein  46.6 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.387647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3500  hypothetical protein  46.6 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3429  hypothetical protein  46.37 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.825866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0807  hypothetical protein  43.74 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0809  hypothetical protein  44.47 
 
 		 433 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2155  protein of unknown function DUF1063  42.32 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0909  hypothetical protein  39.86 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0803  hypothetical protein  39.86 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2144  hypothetical protein  37.09 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0790  hypothetical protein  39.38 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1256  hypothetical protein  37.29 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000902575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1231  protein of unknown function DUF1063  34.37 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000111726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2196  protein of unknown function DUF1063  36.1 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1844  protein of unknown function DUF1063  35.15 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1488  protein of unknown function DUF1063  34.64 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0321  protein of unknown function DUF1063  32.19 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0487  protein of unknown function DUF1063  36.28 
 
 		 442 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 443 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1007  hypothetical protein  31.18 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0811  hypothetical protein  29.9 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000789442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1527  hypothetical protein  32.25 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.844759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0502  protein of unknown function DUF1063  33.33 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.264591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1414  hypothetical protein  31.89 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000941621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1278  hypothetical protein  31.25 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1205  hypothetical protein  27.73 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0921136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0110  hypothetical protein  26.89 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0713  hypothetical protein  26.65 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>