52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1205 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1205  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  784    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0921136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0713  hypothetical protein  86.58 
 
 
397 aa  688    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0110  hypothetical protein  90.63 
 
 
397 aa  711    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1007  hypothetical protein  31.39 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0807  hypothetical protein  26.43 
 
 
428 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0321  protein of unknown function DUF1063  27.8 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0909  hypothetical protein  26.02 
 
 
433 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0809  hypothetical protein  24.72 
 
 
433 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0811  hypothetical protein  30.77 
 
 
423 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000789442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0502  protein of unknown function DUF1063  27.84 
 
 
431 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.264591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1278  hypothetical protein  26.78 
 
 
411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0803  hypothetical protein  30.37 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002893  putative inner membrane protein  26.73 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03081  hypothetical protein  25.94 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3406  hypothetical protein  25.83 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0593  protein of unknown function DUF1063  25.83 
 
 
436 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0790  hypothetical protein  30.14 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0588  hypothetical protein  26 
 
 
436 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02977  hypothetical protein  26 
 
 
436 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1844  protein of unknown function DUF1063  27.1 
 
 
435 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02928  hypothetical protein  26 
 
 
436 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3584  hypothetical protein  26 
 
 
436 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3298  hypothetical protein  26 
 
 
436 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4423  hypothetical protein  26 
 
 
436 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0648812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2196  protein of unknown function DUF1063  25.97 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3249  hypothetical protein  25.77 
 
 
436 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1527  hypothetical protein  26.87 
 
 
429 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.844759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0741  hypothetical protein  26.78 
 
 
425 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3429  hypothetical protein  24.59 
 
 
436 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.825866  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2144  hypothetical protein  27.42 
 
 
431 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3426  putative inner membrane protein  24.76 
 
 
436 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3533  hypothetical protein  24.76 
 
 
436 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.387647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3500  hypothetical protein  24.76 
 
 
436 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2876  hypothetical protein  27.49 
 
 
424 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2793  hypothetical protein  27.49 
 
 
424 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3596  putative inner membrane protein  24.53 
 
 
436 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.062569  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1256  hypothetical protein  25.66 
 
 
417 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000902575  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2972  hypothetical protein  27.01 
 
 
424 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1231  protein of unknown function DUF1063  27.83 
 
 
422 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000111726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4889  hypothetical protein  27.73 
 
 
425 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1403  hypothetical protein  27.23 
 
 
424 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2155  protein of unknown function DUF1063  24.35 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1296  protein of unknown function DUF1063  26.32 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.351062  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3080  hypothetical protein  26.25 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3070  hypothetical protein  26.32 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3223  hypothetical protein  26.32 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.654811  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1209  hypothetical protein  25.3 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2537  hypothetical protein  28.11 
 
 
424 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.518333  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1414  hypothetical protein  26.34 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000941621  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1488  protein of unknown function DUF1063  29.23 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2496  hypothetical protein  23.85 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0487  protein of unknown function DUF1063  24.79 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>