52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0588 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0593  protein of unknown function DUF1063  99.54 
 
 		 436 aa  878    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4423  hypothetical protein  99.54 
 
 		 436 aa  878    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0648812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3596  putative inner membrane protein  84.17 
 
 		 436 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.062569  normal  0.829318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3426  putative inner membrane protein  84.17 
 
 		 436 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3429  hypothetical protein  84.17 
 
 		 436 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.825866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3533  hypothetical protein  83.94 
 
 		 436 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.387647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3500  hypothetical protein  84.17 
 
 		 436 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3249  hypothetical protein  99.08 
 
 		 436 aa  873    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3406  hypothetical protein  99.08 
 
 		 436 aa  875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  881    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3584  hypothetical protein  99.54 
 
 		 436 aa  878    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3298  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  881    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02928  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  881    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02977  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  881    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0809  hypothetical protein  51.86 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002893  putative inner membrane protein  47.25 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03081  hypothetical protein  47.81 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0741  hypothetical protein  47.66 
 
 		 425 aa  348  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0807  hypothetical protein  45.83 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4889  hypothetical protein  47.94 
 
 		 425 aa  343  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2972  hypothetical protein  48.24 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3080  hypothetical protein  47.43 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3070  hypothetical protein  47.43 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3223  hypothetical protein  47.43 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.654811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1296  protein of unknown function DUF1063  47.43 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.351062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2793  hypothetical protein  47.78 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2876  hypothetical protein  47.78 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1403  hypothetical protein  47.78 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2537  hypothetical protein  46.23 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.518333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1209  hypothetical protein  47.33 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2155  protein of unknown function DUF1063  44.57 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0909  hypothetical protein  40.28 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0803  hypothetical protein  38 
 
 		 427 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0790  hypothetical protein  37.53 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1256  hypothetical protein  36.47 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000902575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1844  protein of unknown function DUF1063  37.97 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2144  hypothetical protein  33.64 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2196  protein of unknown function DUF1063  32.72 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1231  protein of unknown function DUF1063  33.1 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000111726  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0811  hypothetical protein  30.81 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000789442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0321  protein of unknown function DUF1063  31.03 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1007  hypothetical protein  31.67 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1488  protein of unknown function DUF1063  35.1 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1527  hypothetical protein  34.82 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.844759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0502  protein of unknown function DUF1063  35 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.264591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0487  protein of unknown function DUF1063  35.68 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2496  hypothetical protein  33.86 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1278  hypothetical protein  28.74 
 
 		 411 aa  161  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1205  hypothetical protein  26.59 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0921136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0110  hypothetical protein  26.65 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0713  hypothetical protein  25.41 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1414  hypothetical protein  30.45 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000941621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>