52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2155 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2155  protein of unknown function DUF1063  100 
 
 
426 aa  859    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0807  hypothetical protein  61.27 
 
 
428 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0809  hypothetical protein  43.46 
 
 
433 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03081  hypothetical protein  42.22 
 
 
425 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002893  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
425 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3426  putative inner membrane protein  44.24 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3500  hypothetical protein  44.24 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173871  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3533  hypothetical protein  44.01 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.387647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2537  hypothetical protein  43.74 
 
 
424 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.518333  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3429  hypothetical protein  44.01 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.825866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3596  putative inner membrane protein  44.01 
 
 
436 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.062569  normal  0.829318 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0593  protein of unknown function DUF1063  44.44 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0909  hypothetical protein  42.86 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4423  hypothetical protein  44.57 
 
 
436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0648812 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02928  hypothetical protein  44.57 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3298  hypothetical protein  44.57 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3584  hypothetical protein  43.98 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02977  hypothetical protein  44.57 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0588  hypothetical protein  44.57 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3406  hypothetical protein  43.85 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3249  hypothetical protein  43.75 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4889  hypothetical protein  42.92 
 
 
425 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3070  hypothetical protein  42.55 
 
 
424 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3223  hypothetical protein  42.55 
 
 
424 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.654811  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1296  protein of unknown function DUF1063  42.55 
 
 
424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.351062  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3080  hypothetical protein  42.55 
 
 
424 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2876  hypothetical protein  42.32 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2793  hypothetical protein  42.32 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2972  hypothetical protein  42.32 
 
 
424 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1209  hypothetical protein  41.84 
 
 
424 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1403  hypothetical protein  42.08 
 
 
424 aa  299  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1256  hypothetical protein  40.66 
 
 
417 aa  295  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000902575  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0741  hypothetical protein  40.98 
 
 
425 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0790  hypothetical protein  39.14 
 
 
427 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0803  hypothetical protein  38.95 
 
 
427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2144  hypothetical protein  39.44 
 
 
431 aa  289  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2196  protein of unknown function DUF1063  38.5 
 
 
428 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1231  protein of unknown function DUF1063  36.79 
 
 
422 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000111726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1844  protein of unknown function DUF1063  41.51 
 
 
435 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0321  protein of unknown function DUF1063  32.18 
 
 
433 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0811  hypothetical protein  32.22 
 
 
423 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000789442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0502  protein of unknown function DUF1063  37.79 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.264591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1527  hypothetical protein  35.85 
 
 
429 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.844759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0487  protein of unknown function DUF1063  38.32 
 
 
442 aa  199  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1488  protein of unknown function DUF1063  37.79 
 
 
446 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1007  hypothetical protein  29.15 
 
 
397 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2496  hypothetical protein  35.93 
 
 
443 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1414  hypothetical protein  32.64 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000941621  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1278  hypothetical protein  25.84 
 
 
411 aa  154  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1205  hypothetical protein  25.41 
 
 
396 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0921136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0110  hypothetical protein  26.17 
 
 
397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.108838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0713  hypothetical protein  26.4 
 
 
397 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.570967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>