More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1569 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1569  folylpolyglutamate synthetase  100 
 
 		 382 aa  775    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1616  FolC bifunctional protein  46.98 
 
 		 383 aa  329  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0713  putative periplasmic protein  42.82 
 
 		 395 aa  323  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0077  valyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0734  folylpolyglutamate synthase  42.86 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00291399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0471  folylpolyglutamate synthase  41.62 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1106  folC bifunctional protein  40.58 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1231  folC bifunctional protein  40.58 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1042  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.66 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0635  folC bifunctional protein  39.27 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  30.73 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  29.41 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  29.23 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  28.99 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  28.99 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  29.06 
 
 		 431 aa  145  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  28.68 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  28.68 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  28.75 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  30.05 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  29.66 
 
 		 421 aa  135  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1156  FolC bifunctional protein  26.34 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.482088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  28.72 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  27.7 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.24 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  25 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  27.56 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  29.52 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  27.3 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  28.5 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  27.46 
 
 		 436 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  30.46 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  30 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  28.47 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  29.41 
 
 		 430 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  26.42 
 
 		 435 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  27.45 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  28.02 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2076  dihydrofolate synthase  27.41 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  27.39 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  29.61 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  25.72 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  28.61 
 
 		 419 aa  119  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  33.76 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.78 
 
 		 422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.78 
 
 		 422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  27.14 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  25.18 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  30.03 
 
 		 414 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  29.59 
 
 		 437 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.53 
 
 		 422 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  27.53 
 
 		 448 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.53 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  27.97 
 
 		 442 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  25.35 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  26.27 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  27.95 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  25.69 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0264  FolC bifunctional protein  28.7 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  26.98 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.53 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  29.53 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.53 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.51 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.51 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.51 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  28.66 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  29.53 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  26.88 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  29.17 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  27.2 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0733  folylpolyglutamate synthase  33.03 
 
 		 441 aa  113  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.136275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  25.48 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  27.16 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  26.46 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  37.64 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  28.5 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  27.16 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.28 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  38.76 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  25.62 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  27.7 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  28.33 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  27.66 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  28.09 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  39.63 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  25.55 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1591  FolC bifunctional protein  27.7 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  26.76 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  38.41 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  26.9 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  27.6 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  28.36 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  30.62 
 
 		 499 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  26.43 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  27.53 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  27.79 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  27.76 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>