More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0713 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0713  putative periplasmic protein  100 
 
 
395 aa  809    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0077  valyl-tRNA synthetase  68 
 
 
400 aa  555  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0471  folylpolyglutamate synthase  54.03 
 
 
391 aa  413  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0734  folylpolyglutamate synthase  48.88 
 
 
389 aa  353  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00291399  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1042  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46 
 
 
389 aa  334  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1569  folylpolyglutamate synthetase  42.82 
 
 
382 aa  323  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1231  folC bifunctional protein  42.32 
 
 
390 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1106  folC bifunctional protein  42.32 
 
 
390 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0635  folC bifunctional protein  42.07 
 
 
390 aa  316  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1616  FolC bifunctional protein  44.87 
 
 
383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  31.15 
 
 
432 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  30.37 
 
 
432 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  30.69 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  29.92 
 
 
431 aa  143  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  30.83 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  29.65 
 
 
421 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  30.38 
 
 
423 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  30.38 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  30.38 
 
 
423 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  29.4 
 
 
423 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  30.5 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  30.65 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  30.29 
 
 
425 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 
425 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  30.05 
 
 
430 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  28.16 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  30.21 
 
 
425 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  31.52 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  30.79 
 
 
429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  31.28 
 
 
428 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.27 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2076  dihydrofolate synthase  30.38 
 
 
427 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  31.4 
 
 
434 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  30.05 
 
 
428 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  30.36 
 
 
423 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  31.58 
 
 
418 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  31.01 
 
 
435 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  25.49 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  29.62 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  27.52 
 
 
543 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  29.76 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  27.12 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  29.77 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  29.05 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  28.53 
 
 
444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  30.77 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  27.03 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  29.59 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  28.53 
 
 
448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  29.23 
 
 
447 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  27.59 
 
 
437 aa  120  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  36.17 
 
 
442 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  25.25 
 
 
433 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  27.59 
 
 
435 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  30.48 
 
 
429 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.17 
 
 
421 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  31.03 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  25 
 
 
433 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  25 
 
 
433 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  25 
 
 
433 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.79 
 
 
431 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  29.13 
 
 
432 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  28.57 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  27.74 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  29.91 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  25.42 
 
 
433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1555  FolC bifunctional protein  28.84 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  28.08 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  29.84 
 
 
421 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.76 
 
 
427 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  32.01 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  27.69 
 
 
468 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  28.5 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 
428 aa  115  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 
408 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.65 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  44.06 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  27.71 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  24.75 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  26.4 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  24.26 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  31.6 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  28.14 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  30.51 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  43.66 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.45 
 
 
470 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  27.82 
 
 
432 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  28.72 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  30.91 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  28.9 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  26.85 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  29.85 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0673  FolC bifunctional protein  30.19 
 
 
436 aa  113  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  28.02 
 
 
429 aa  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  27.36 
 
 
407 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  24.75 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>