More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0483 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 492 aa  977    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  55.44 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  55.56 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  51.77 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  43.75 
 
 		 407 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  40.78 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  41.43 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  40.8 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.61 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  26 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16744  predicted protein  32.44 
 
 		 486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.544898  normal  0.122901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.79 
 
 		 441 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  35.8 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.02 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  40.8 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  43.01 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  28.31 
 
 		 431 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  29.53 
 
 		 543 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  39.58 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0857  FolC bifunctional protein  38.71 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  38.26 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13501  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  34.66 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  38.06 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.42 
 
 		 424 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.59 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.07 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  28.72 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  38.54 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  29.29 
 
 		 429 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19851  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  38.7 
 
 		 413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0732491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  44.62 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  43.63 
 
 		 448 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.47 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.47 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  40.85 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  28.76 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  37.93 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  40.83 
 
 		 408 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  37.5 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  38.08 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 		 437 aa  133  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  36.29 
 
 		 526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  33.45 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.56 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  39.04 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  40.85 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  41.26 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  40.74 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29778  predicted protein  35.05 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00217101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  38.71 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13191  predicted protein  35.05 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0659517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.68 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  43.5 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  29.97 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  41.8 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.49 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.48 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  33.85 
 
 		 438 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  34.15 
 
 		 436 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  40.96 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  36.46 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2872  FolC bifunctional protein  36.88 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.660118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  41.8 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.75 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1535  folylpolyglutamate synthetase  39.16 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 		 412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  29.38 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  41.5 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.06 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 		 425 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.33 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 		 441 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  33.85 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  39.9 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  37.14 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.4 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  39.2 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.63 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.63 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.63 
 
 		 422 aa  127  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  38.42 
 
 		 515 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.63 
 
 		 422 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  38.35 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  34.19 
 
 		 431 aa  126  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 		 410 aa  126  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  36.63 
 
 		 441 aa  126  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  34.63 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.82 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  34.63 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.63 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.25 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0733  folylpolyglutamate synthase  31.66 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.136275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  48.34 
 
 		 421 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>