More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3497 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  100 
 
 
526 aa  1017    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  59.43 
 
 
466 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  61.88 
 
 
468 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  60.82 
 
 
461 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  55.33 
 
 
463 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  56.08 
 
 
477 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  54.89 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.47 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.19 
 
 
470 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  50.21 
 
 
471 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  55.35 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  53.88 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  55.7 
 
 
515 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  54.26 
 
 
460 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  54.95 
 
 
452 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  54.2 
 
 
447 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  50.54 
 
 
508 aa  392  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  48.03 
 
 
452 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  49.45 
 
 
452 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  47.15 
 
 
485 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  52.49 
 
 
468 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  50.75 
 
 
471 aa  375  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  53.42 
 
 
445 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50.55 
 
 
462 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  49.55 
 
 
487 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  45.58 
 
 
543 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  53.05 
 
 
448 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  48.56 
 
 
444 aa  362  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  48.45 
 
 
444 aa  359  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  51.45 
 
 
471 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  49.67 
 
 
517 aa  345  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  52.47 
 
 
467 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  52.24 
 
 
467 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  52.24 
 
 
467 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  51.46 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  46.78 
 
 
448 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 
431 aa  240  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
434 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.88 
 
 
443 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.59 
 
 
437 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.59 
 
 
435 aa  224  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.92 
 
 
429 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
424 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  30.24 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.54 
 
 
429 aa  220  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  38.96 
 
 
459 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.05 
 
 
466 aa  217  5e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.45 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.45 
 
 
433 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.45 
 
 
433 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.45 
 
 
433 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.45 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.46 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  40.16 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.38 
 
 
433 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  35.98 
 
 
440 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  33.92 
 
 
437 aa  211  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.13 
 
 
431 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.15 
 
 
433 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  39.38 
 
 
424 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 
428 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  35.66 
 
 
431 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  30.59 
 
 
428 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.54 
 
 
433 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  36.04 
 
 
433 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  27.08 
 
 
413 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
438 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  33.95 
 
 
439 aa  204  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  41.11 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  30.85 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.81 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 
428 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.09 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  30.93 
 
 
433 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.66 
 
 
424 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  36.97 
 
 
422 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.47 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.02 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.16 
 
 
425 aa  197  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  35.26 
 
 
437 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.12 
 
 
441 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
451 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  34.55 
 
 
429 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 
441 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  31.62 
 
 
435 aa  193  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0625  FolC bifunctional protein  32.5 
 
 
474 aa  193  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
435 aa  193  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.26 
 
 
426 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  35.46 
 
 
429 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  38.33 
 
 
813 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.79 
 
 
457 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  32.33 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.1 
 
 
424 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  27.67 
 
 
413 aa  189  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 
447 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
424 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.63 
 
 
424 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>