More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1310 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  100 
 
 
499 aa  984    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  55.85 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  48.37 
 
 
444 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  47.11 
 
 
435 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  41.65 
 
 
413 aa  285  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  39.47 
 
 
407 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.5 
 
 
441 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  32.95 
 
 
424 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  29.63 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.09 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.31 
 
 
424 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  35.95 
 
 
442 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  35.14 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.68 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  34.31 
 
 
424 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 
412 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  34.39 
 
 
421 aa  171  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  40.05 
 
 
403 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
425 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  28.76 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  30.51 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
448 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  38.38 
 
 
435 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.48 
 
 
416 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  34.6 
 
 
381 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  27.9 
 
 
429 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  35.08 
 
 
437 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.86 
 
 
427 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.6 
 
 
466 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  33.69 
 
 
448 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  39.84 
 
 
408 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  29 
 
 
459 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.42 
 
 
447 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
448 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 
414 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  27.15 
 
 
425 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  40.43 
 
 
408 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  29.96 
 
 
438 aa  157  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  33.48 
 
 
442 aa  157  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  31.29 
 
 
440 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19851  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  32.35 
 
 
413 aa  156  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0732491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0857  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 
404 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  27.33 
 
 
433 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 
404 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  34.41 
 
 
463 aa  154  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  30.7 
 
 
425 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  25.72 
 
 
419 aa  154  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16744  predicted protein  36.07 
 
 
486 aa  154  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.544898  normal  0.122901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  31.71 
 
 
434 aa  154  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  35.06 
 
 
461 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  36.36 
 
 
440 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
441 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  27.69 
 
 
424 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  39.45 
 
 
408 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  30.66 
 
 
434 aa  152  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  34.07 
 
 
438 aa  152  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
438 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  36.29 
 
 
448 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13501  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  28.82 
 
 
413 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.37 
 
 
422 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  29.91 
 
 
431 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  36.9 
 
 
414 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  26.85 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  31.1 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 
453 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
438 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  34.83 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  32.76 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0673  FolC bifunctional protein  25.45 
 
 
436 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  32.58 
 
 
423 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  29.74 
 
 
420 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.92 
 
 
422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  26.36 
 
 
432 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  26.23 
 
 
443 aa  146  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.86 
 
 
422 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  36.01 
 
 
441 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  27.62 
 
 
457 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.7 
 
 
439 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  35.95 
 
 
441 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  34.92 
 
 
444 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  36.59 
 
 
461 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  31 
 
 
430 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.22 
 
 
422 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  32.31 
 
 
432 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34 
 
 
422 aa  143  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  26.32 
 
 
433 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  27.47 
 
 
422 aa  142  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  33.53 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  35.43 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  28.35 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0733  folylpolyglutamate synthase  26.98 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.136275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  25.41 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  33.63 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  32.75 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  28.97 
 
 
435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  35.09 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>