More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2729 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  100 
 
 
453 aa  897    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  61.69 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  51.22 
 
 
435 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  45.7 
 
 
442 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  46.95 
 
 
442 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  47.95 
 
 
442 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  46.87 
 
 
448 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  46.98 
 
 
448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.29 
 
 
432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  47.21 
 
 
447 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  45.19 
 
 
447 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  46.19 
 
 
444 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  48.97 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  47.59 
 
 
437 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  44.24 
 
 
442 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  46.96 
 
 
447 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  44.47 
 
 
442 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  44.95 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  47.79 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  44.93 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  42.86 
 
 
442 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  42.63 
 
 
442 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  44.06 
 
 
441 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 
423 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  44.06 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  42.73 
 
 
470 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  42.62 
 
 
430 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  44.62 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  41.51 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  45.12 
 
 
438 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  46.96 
 
 
424 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  46.57 
 
 
412 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  44.16 
 
 
441 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  44.47 
 
 
447 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  44.24 
 
 
422 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  39.77 
 
 
440 aa  286  8e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  43.42 
 
 
441 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  46.1 
 
 
422 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  40.68 
 
 
467 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  44.92 
 
 
437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  36.86 
 
 
429 aa  263  6.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  37.53 
 
 
434 aa  257  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  36.65 
 
 
435 aa  253  5.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  36.86 
 
 
442 aa  242  7.999999999999999e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  39.9 
 
 
397 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.78 
 
 
426 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 
412 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
443 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  40.14 
 
 
403 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 
425 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  34.92 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.13 
 
 
466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  40.33 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
420 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  35.5 
 
 
416 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.54 
 
 
425 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.3 
 
 
431 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.08 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  33.66 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 
408 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 
418 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.63 
 
 
427 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  39.94 
 
 
422 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 
432 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  34.49 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
424 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 
414 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  30.7 
 
 
457 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.36 
 
 
428 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.78 
 
 
428 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  35.56 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.37 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.1 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 
447 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
429 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  38.76 
 
 
437 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  35.26 
 
 
431 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.41 
 
 
441 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.02 
 
 
431 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
434 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.53 
 
 
424 aa  176  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  31.57 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.9 
 
 
431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.1 
 
 
878 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.7 
 
 
441 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.14 
 
 
437 aa  172  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 
424 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
422 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
433 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.14 
 
 
435 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  31.08 
 
 
423 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 
408 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  30.91 
 
 
431 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  31 
 
 
423 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  30.86 
 
 
423 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>