More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0140 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 444 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  53.78 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  54.82 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  52.3 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  52.08 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  50.92 
 
 		 442 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  51.52 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  51.82 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  50.69 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  52.05 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  52.21 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  51.82 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  52.95 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  54.79 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  54.36 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.76 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  50.57 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  52.73 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  50.78 
 
 		 470 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  50.93 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  55.35 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  51.14 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  51.03 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  50.8 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  55.13 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  52.35 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  57.01 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  48.16 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  54.76 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  49.18 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  48.62 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  49.44 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  51.02 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  48.61 
 
 		 432 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  46.19 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 		 467 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.26 
 
 		 437 aa  328  8e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  47.99 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  40.28 
 
 		 435 aa  299  8e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  43.04 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  39.2 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  41.19 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  36.32 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.53 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.98 
 
 		 426 aa  249  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.56 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  41.46 
 
 		 422 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  37.21 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.55 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.94 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  32.22 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.27 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.64 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.53 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  38.15 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.39 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.96 
 
 		 443 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.89 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.07 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 		 424 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  37.72 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.21 
 
 		 438 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.03 
 
 		 416 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.37 
 
 		 422 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  40.63 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.86 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.65 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  38.01 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.02 
 
 		 441 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.64 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  32.25 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.13 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 		 437 aa  186  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.76 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.5 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  32.25 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  34.48 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.41 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  29.48 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  32.26 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.61 
 
 		 433 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.06 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.57 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>