More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0632 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  85.68 
 
 		 442 aa  741    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 448 aa  884    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  87.5 
 
 		 448 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  76.54 
 
 		 447 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  69.59 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  69.87 
 
 		 442 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  69.16 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  59.18 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  57.37 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  57.37 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  56.02 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  57.83 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  54.17 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  55.35 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  52.68 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  51.04 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  50.81 
 
 		 442 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  52.69 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  50.93 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  51.98 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  49.07 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  49.08 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  52.8 
 
 		 422 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  47.24 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  51.76 
 
 		 437 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  53.95 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  47 
 
 		 442 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  51.64 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  45.43 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  50.23 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  52.46 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  46.98 
 
 		 453 aa  339  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  47.44 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  51.88 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  46.29 
 
 		 397 aa  316  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  49.19 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  39.08 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  45.1 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  40.19 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  38.62 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  42 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.35 
 
 		 442 aa  239  8e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.26 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  36.01 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.36 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  43.03 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.93 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.68 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 		 438 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32.63 
 
 		 418 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  35.69 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.42 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  38.77 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.63 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.21 
 
 		 466 aa  186  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.76 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.29 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.95 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.03 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.89 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.26 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  37.41 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  35.38 
 
 		 427 aa  179  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  40 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  34.88 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  42.35 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.68 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.11 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  35.09 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.79 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.32 
 
 		 433 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  37.26 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.79 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  30.94 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  30.94 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.85 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.02 
 
 		 381 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>