More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0333 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  100 
 
 
414 aa  799    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  50 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  39.39 
 
 
459 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  39.91 
 
 
431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  41.43 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  41.55 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  31.99 
 
 
422 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  43.68 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 
431 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  44.36 
 
 
424 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
435 aa  237  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
437 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
429 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  32.7 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  41.92 
 
 
424 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.15 
 
 
433 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.07 
 
 
433 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.83 
 
 
433 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.3 
 
 
433 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 
441 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.83 
 
 
433 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  38.54 
 
 
433 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 
441 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 
431 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.07 
 
 
433 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.83 
 
 
433 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.83 
 
 
433 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.83 
 
 
433 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.83 
 
 
433 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  43.1 
 
 
426 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  39.47 
 
 
422 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  38.05 
 
 
432 aa  223  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  37.53 
 
 
813 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.39 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.72 
 
 
427 aa  221  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
431 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.63 
 
 
429 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  39.25 
 
 
440 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  37.05 
 
 
447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.19 
 
 
428 aa  216  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.43 
 
 
817 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  31.41 
 
 
432 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 
443 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  43.93 
 
 
381 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  36.24 
 
 
878 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.3 
 
 
434 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.57 
 
 
421 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
847 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.51 
 
 
457 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 
435 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  29.82 
 
 
438 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  32.62 
 
 
423 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  32.62 
 
 
423 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  35.48 
 
 
840 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  34.99 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.91 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  41.86 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.46 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  34.14 
 
 
810 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  32.92 
 
 
382 aa  199  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  38.8 
 
 
463 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2632  FolC bifunctional protein  38.42 
 
 
403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  35.71 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.62 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  36.17 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  42.08 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0083  FolC bifunctional protein  41.19 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  38.57 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
428 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  41.19 
 
 
403 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  43.79 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.83 
 
 
427 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
410 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.49 
 
 
422 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
421 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  35.89 
 
 
422 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  38.93 
 
 
428 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  38.18 
 
 
429 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.31 
 
 
439 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  35.48 
 
 
416 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.7 
 
 
431 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  34.88 
 
 
438 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 
438 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  38.24 
 
 
437 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.01 
 
 
451 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  30.2 
 
 
419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  30.52 
 
 
425 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  39.16 
 
 
389 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.55 
 
 
466 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  38.21 
 
 
440 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 
418 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  33.65 
 
 
434 aa  189  7e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  33.42 
 
 
418 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
420 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  39.29 
 
 
440 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.63 
 
 
422 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.6 
 
 
424 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>