More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1227 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  100 
 
 		 421 aa  852    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  78.1 
 
 		 423 aa  689    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  78.1 
 
 		 423 aa  689    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  44.19 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  43.56 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.09 
 
 		 433 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  43.33 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.56 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  43.9 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.79 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  42.86 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  42.86 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  42.86 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  43.56 
 
 		 433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.33 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  42.96 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  43.39 
 
 		 420 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  42.65 
 
 		 420 aa  332  5e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  38.43 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  36.98 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  38.68 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  36.49 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  34.14 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.93 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.93 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  35.28 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  29.89 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.63 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  34.04 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  30.9 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  32.15 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.04 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  30.63 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.63 
 
 		 466 aa  206  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  33.16 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  31.73 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.42 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  29.44 
 
 		 440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  30.83 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  28.57 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.76 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  30.19 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.58 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  30.42 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  31.31 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  30.35 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  29.56 
 
 		 817 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  28.93 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  28.71 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  30.26 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  31.21 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  31.1 
 
 		 428 aa  186  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.69 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  32.63 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  31.99 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  29.62 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  30.16 
 
 		 847 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  28.31 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  29.36 
 
 		 813 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 		 438 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  29.66 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  29.18 
 
 		 878 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0673  FolC bifunctional protein  34.36 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  30.66 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  29.14 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  32.24 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  28.61 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  28.76 
 
 		 810 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  30.16 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  32.37 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  29.71 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  29.97 
 
 		 463 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  32.12 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  29.36 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  34.74 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  34.74 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  30.71 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  28.92 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.27 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  28.41 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  30.98 
 
 		 429 aa  167  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.26 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.9 
 
 		 517 aa  166  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0455  folylpolyglutamate synthase  30.05 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1591  FolC bifunctional protein  28.03 
 
 		 412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>