More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0016 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  100 
 
 		 439 aa  893    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  87.41 
 
 		 437 aa  761    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  82.19 
 
 		 438 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  40.32 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  38.99 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.6 
 
 		 466 aa  272  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  36.97 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  38.02 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  37.41 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  35.38 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.7 
 
 		 459 aa  256  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  35.38 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  35.22 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.64 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  37.3 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.36 
 
 		 424 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 		 434 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  36.94 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.87 
 
 		 440 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.39 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  34.22 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.88 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  34.98 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.71 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  34.1 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  39.64 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  38.43 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  35.13 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.95 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  37.17 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.18 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  35.32 
 
 		 813 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.97 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  35.71 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  32.39 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  37.12 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.77 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  36.39 
 
 		 433 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  35.09 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  34.21 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 817 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  35.16 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 		 847 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 		 878 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  36.59 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  36.17 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  33.93 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  36.74 
 
 		 421 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  33.49 
 
 		 416 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.13 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.98 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.8 
 
 		 433 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.73 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.97 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  41.42 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  30.02 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  34.22 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.83 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.88 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  38.08 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  35.4 
 
 		 810 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.97 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.97 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.97 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.97 
 
 		 433 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  40.23 
 
 		 423 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  32.93 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  31.48 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 		 840 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.21 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  31.68 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  34.91 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.56 
 
 		 466 aa  194  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.81 
 
 		 517 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  32.29 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  36.84 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  31.83 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1084  folylpolyglutamate synthetase, putative  31.29 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.41 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>