More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3277 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  100 
 
 
424 aa  857    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  60.85 
 
 
424 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  60.85 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  61.32 
 
 
424 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  52.47 
 
 
425 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  59.32 
 
 
381 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  44.39 
 
 
422 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  46.26 
 
 
428 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  38.06 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  41.29 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 
459 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  38.16 
 
 
428 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  41.2 
 
 
434 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  37.32 
 
 
424 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  36.68 
 
 
428 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  34.26 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  34.26 
 
 
433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  34.26 
 
 
433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.26 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  34.26 
 
 
433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  36.61 
 
 
428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.26 
 
 
433 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.09 
 
 
433 aa  272  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  37.67 
 
 
457 aa  272  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.26 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 
433 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  33.8 
 
 
433 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  42 
 
 
426 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  38.02 
 
 
431 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  38.19 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.79 
 
 
429 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  38.9 
 
 
440 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  36.77 
 
 
429 aa  264  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  36.62 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
431 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
441 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  34.43 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.07 
 
 
427 aa  259  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  36.76 
 
 
428 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.41 
 
 
466 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
424 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
443 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
433 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  38.24 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  36.02 
 
 
408 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  37.84 
 
 
437 aa  249  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 
433 aa  249  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 
465 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  37.27 
 
 
813 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  36.19 
 
 
435 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  37.81 
 
 
426 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
432 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  36.05 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  36.51 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.12 
 
 
427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 
436 aa  242  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  38.29 
 
 
878 aa  242  9e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  38.08 
 
 
429 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  37.09 
 
 
817 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  37.14 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  37.19 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  38 
 
 
454 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  39.6 
 
 
421 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 
438 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 
438 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  38 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
447 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  39.36 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
438 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  37.62 
 
 
425 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  35.11 
 
 
437 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.23 
 
 
439 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
412 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  38.16 
 
 
461 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.33 
 
 
427 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  36.53 
 
 
428 aa  227  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  35.07 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.74 
 
 
413 aa  226  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.39 
 
 
421 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  31.09 
 
 
438 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  35.43 
 
 
420 aa  225  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  35.77 
 
 
416 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  33.74 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 
461 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 
435 aa  222  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  39.18 
 
 
414 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  33.75 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  35.84 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.21 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  37.8 
 
 
442 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  34.37 
 
 
434 aa  219  6e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  33.5 
 
 
418 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  32.21 
 
 
419 aa  219  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  30.55 
 
 
425 aa  219  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 
508 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  38.1 
 
 
440 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>