More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1160 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  100 
 
 
425 aa  850    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  54.35 
 
 
424 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  52.47 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  53.41 
 
 
424 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  53.18 
 
 
424 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  52.09 
 
 
381 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 
428 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  38.69 
 
 
431 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
429 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.77 
 
 
422 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.01 
 
 
427 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.04 
 
 
459 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 
434 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
428 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.7 
 
 
429 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.57 
 
 
431 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
424 aa  236  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  36.62 
 
 
422 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.29 
 
 
427 aa  233  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.61 
 
 
466 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  35.91 
 
 
440 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.89 
 
 
441 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  39.21 
 
 
414 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 
428 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 
441 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  35.82 
 
 
447 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  36.09 
 
 
878 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  30.59 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32 
 
 
431 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.63 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  38.52 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  36.49 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  32.61 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  34.41 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
433 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 
438 aa  212  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  31.54 
 
 
431 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.77 
 
 
439 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  37.68 
 
 
437 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  31.74 
 
 
428 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.33 
 
 
457 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
413 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  32.6 
 
 
429 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  34.04 
 
 
422 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  36.7 
 
 
433 aa  210  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.75 
 
 
424 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  34.1 
 
 
813 aa  209  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  38.44 
 
 
442 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  34.67 
 
 
428 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.58 
 
 
408 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
437 aa  207  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
428 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
435 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  33.5 
 
 
434 aa  206  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  34.71 
 
 
437 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  28.85 
 
 
433 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.67 
 
 
403 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  29.01 
 
 
404 aa  203  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.2 
 
 
416 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  31.98 
 
 
436 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  30.16 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  37.83 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.85 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  28.61 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  28.61 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.61 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  28.61 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.61 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  36.28 
 
 
438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  33.52 
 
 
420 aa  199  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  33.49 
 
 
847 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  36.55 
 
 
447 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  32.77 
 
 
435 aa  199  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.61 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  27.88 
 
 
433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  30.93 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
817 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  38.42 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.57 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  34.97 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.82 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  33.68 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  28.03 
 
 
433 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
461 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  38.61 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
442 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  29.57 
 
 
404 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 
447 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  36.31 
 
 
444 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  34.44 
 
 
428 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  41.46 
 
 
408 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.51 
 
 
451 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 
442 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>