More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1739 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  100 
 
 
444 aa  894    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  48.37 
 
 
499 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  43.71 
 
 
413 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  55.56 
 
 
492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  40.36 
 
 
407 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  40 
 
 
424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.21 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.21 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  36.59 
 
 
463 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.01 
 
 
425 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  39.95 
 
 
424 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.71 
 
 
466 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.68 
 
 
422 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  35.6 
 
 
468 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 
429 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 
433 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  32.81 
 
 
431 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  35.41 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.73 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  29.06 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 
442 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.29 
 
 
441 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  33.86 
 
 
461 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  33.77 
 
 
444 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 
452 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  35.8 
 
 
461 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.56 
 
 
466 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  34.33 
 
 
422 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.3 
 
 
451 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  34.34 
 
 
448 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  35.88 
 
 
453 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  37.46 
 
 
441 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  34.92 
 
 
425 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  33.8 
 
 
485 aa  167  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  35.41 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  33.05 
 
 
444 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0857  FolC bifunctional protein  42.03 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.18 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  31.83 
 
 
440 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  33.33 
 
 
543 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 
441 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 
441 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  40.47 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  32.26 
 
 
410 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
438 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  33.93 
 
 
443 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  39.62 
 
 
381 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  28.92 
 
 
459 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.1 
 
 
422 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  35.08 
 
 
411 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.51 
 
 
470 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.96 
 
 
464 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
421 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
452 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.72 
 
 
439 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  42.22 
 
 
408 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
441 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
441 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  35.22 
 
 
468 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 
412 aa  160  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  34.37 
 
 
440 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19851  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  37.58 
 
 
413 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0732491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  38.11 
 
 
432 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 
425 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.78 
 
 
433 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
428 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  31.78 
 
 
426 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.2 
 
 
433 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
432 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 
426 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  36.99 
 
 
437 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  29.31 
 
 
424 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
437 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  29.32 
 
 
427 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
452 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
453 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  29.15 
 
 
408 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  30.29 
 
 
428 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.28 
 
 
427 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  27.9 
 
 
422 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1535  folylpolyglutamate synthetase  40.82 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  34.98 
 
 
437 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  32.62 
 
 
428 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  33.52 
 
 
434 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.03 
 
 
437 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  31.25 
 
 
404 aa  156  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  28.54 
 
 
433 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  28.54 
 
 
433 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.75 
 
 
422 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  28.54 
 
 
433 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.54 
 
 
433 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  34.65 
 
 
414 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  42.22 
 
 
408 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.61 
 
 
433 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  41.62 
 
 
408 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>