More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1996 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  100 
 
 
428 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  51.26 
 
 
428 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  52.53 
 
 
433 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  49.88 
 
 
428 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  46.62 
 
 
429 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  45.43 
 
 
408 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  46.71 
 
 
404 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  45.18 
 
 
404 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  44.73 
 
 
429 aa  362  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  40.37 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  37.64 
 
 
429 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 
431 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  35.67 
 
 
457 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
431 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  37.75 
 
 
453 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 
459 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.76 
 
 
424 aa  247  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  34.54 
 
 
813 aa  246  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  36.28 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 
422 aa  243  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.1 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  39.34 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  39.34 
 
 
437 aa  239  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  34.68 
 
 
433 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.84 
 
 
429 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.2 
 
 
422 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.56 
 
 
817 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  36.12 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  34.48 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 
432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  34.86 
 
 
433 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.51 
 
 
434 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35 
 
 
433 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  33.63 
 
 
433 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34 
 
 
433 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.66 
 
 
424 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.86 
 
 
433 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  34.48 
 
 
433 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  34.48 
 
 
433 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  34.48 
 
 
433 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.48 
 
 
433 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 
426 aa  225  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.41 
 
 
431 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.54 
 
 
847 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.08 
 
 
427 aa  225  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  33.26 
 
 
810 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  33.79 
 
 
433 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 
441 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.81 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.56 
 
 
466 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  36.13 
 
 
422 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.78 
 
 
451 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.86 
 
 
427 aa  216  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  32.92 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
428 aa  216  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  36.92 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  33.88 
 
 
424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.93 
 
 
447 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 
436 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
411 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 
435 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  33.04 
 
 
878 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  35.61 
 
 
474 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  37.33 
 
 
428 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
465 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  31.89 
 
 
840 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 
424 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
424 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 
425 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.53 
 
 
416 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
425 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 
430 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 
428 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  35.48 
 
 
438 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.16 
 
 
439 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  31.17 
 
 
437 aa  203  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  35.39 
 
 
422 aa  202  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  35.4 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  36.03 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  36.19 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  31.31 
 
 
420 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 
438 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  36.12 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  36.12 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  34.79 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  34.07 
 
 
413 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.35 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 
440 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  37.82 
 
 
441 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 
452 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
453 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 
407 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 
445 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>