More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2308 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 442 aa  881    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  37.29 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  40.37 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  38.32 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  34.52 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  36.89 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  39.76 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  35.68 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  38.19 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  36.72 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  39.69 
 
 		 457 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  39.49 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  38.13 
 
 		 431 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 		 404 aa  236  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.47 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.96 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  34.38 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.39 
 
 		 433 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  35.14 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.82 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  33.66 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  33.66 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  33.66 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  34.58 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  33.9 
 
 		 433 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.41 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.5 
 
 		 429 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  38.67 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.18 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.35 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  29.9 
 
 		 413 aa  223  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  36.77 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.67 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  36.52 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  38.22 
 
 		 453 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 		 414 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  36.9 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  35.71 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  35.32 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  38.41 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  38.41 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.78 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  37.28 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  41.18 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.7 
 
 		 431 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  38.83 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 		 435 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.16 
 
 		 421 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.29 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  31.8 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  36.57 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  30.59 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.96 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  42.36 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  33.78 
 
 		 810 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  40.16 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  31.05 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.6 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.87 
 
 		 817 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  30.29 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.88 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.55 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  38.8 
 
 		 445 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  33.24 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  37.3 
 
 		 813 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  39.69 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  34.53 
 
 		 474 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  37.18 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  34.95 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  38.63 
 
 		 420 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.82 
 
 		 847 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.42 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.43 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  37.8 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  31.8 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  27.04 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  31.47 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.91 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  33.76 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  30.65 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  33.86 
 
 		 878 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>