More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0505 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 407 aa  814    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  40.62 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  40.13 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  39.35 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  39.25 
 
 		 499 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  43.75 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  37.59 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  28.64 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.74 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  35.91 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 		 431 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  28.23 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.92 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  29.34 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  34.52 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.61 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  28.43 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  31.84 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.33 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  28.33 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  28.33 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  28.33 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.43 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 		 468 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.94 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  28.68 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  29.73 
 
 		 431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  26.84 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  31.04 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  34.12 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  33.01 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  26.81 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  26.7 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  33.98 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  30.42 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  42.49 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  31.37 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  30.26 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  27.51 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.9 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  30.26 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  30.53 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  34.96 
 
 		 461 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  31.56 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  29.25 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  27.03 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  33.08 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  30.41 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  30.66 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.05 
 
 		 422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.76 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.05 
 
 		 422 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  33.24 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.16 
 
 		 422 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.43 
 
 		 466 aa  145  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.33 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  29.93 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  30.66 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  33.59 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.05 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.76 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  29.89 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  30.42 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.06 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  31.98 
 
 		 543 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.4 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  30.19 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.67 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.41 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  27.6 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.76 
 
 		 422 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.76 
 
 		 422 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  30.6 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 		 438 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  30.71 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  35.8 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.51 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  28.47 
 
 		 443 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.76 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  29.76 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  29.76 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.76 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.4 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  30.27 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  34.38 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  42.64 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04840  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase, putative  34.51 
 
 		 497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  42.86 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  32.27 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  28.21 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>