More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0759 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  100 
 
 
413 aa  832    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  42.47 
 
 
444 aa  285  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  40.9 
 
 
435 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  41.65 
 
 
499 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  40.62 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 
492 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  36.73 
 
 
404 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.06 
 
 
424 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.09 
 
 
466 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  37 
 
 
461 aa  163  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 
425 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  33.82 
 
 
424 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 
424 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
423 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  32.84 
 
 
422 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  35.24 
 
 
442 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  34.92 
 
 
442 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.93 
 
 
422 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  29.71 
 
 
428 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  29.81 
 
 
429 aa  155  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.66 
 
 
421 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16744  predicted protein  33.33 
 
 
486 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.544898  normal  0.122901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
424 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  32.14 
 
 
427 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
422 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  34.16 
 
 
403 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 
422 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  33.58 
 
 
422 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.17 
 
 
422 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.58 
 
 
422 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  31.28 
 
 
434 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  32.08 
 
 
412 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.81 
 
 
422 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19851  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  38.6 
 
 
413 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0732491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0857  FolC bifunctional protein  36.78 
 
 
404 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 
438 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  28.54 
 
 
410 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  33.89 
 
 
442 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  32.41 
 
 
428 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  34.43 
 
 
423 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 
448 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  31.46 
 
 
428 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  30.48 
 
 
418 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0083  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.89 
 
 
422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  30.48 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.93 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.36 
 
 
422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  29.17 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  35.23 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  34.34 
 
 
414 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  32.41 
 
 
428 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  33.83 
 
 
442 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1535  folylpolyglutamate synthetase  36.39 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  27.94 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
453 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
422 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  35.49 
 
 
447 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  27.55 
 
 
441 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  29 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  28.81 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.13 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04840  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase, putative  32.81 
 
 
497 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  32.92 
 
 
432 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
434 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  33.44 
 
 
438 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  31.39 
 
 
425 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
430 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.45 
 
 
422 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
434 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
434 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  36.19 
 
 
448 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
432 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  37 
 
 
386 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  30.79 
 
 
810 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  30.07 
 
 
420 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  35.93 
 
 
441 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  35.23 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  26.36 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  38.55 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  33.83 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  38.86 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1084  folylpolyglutamate synthetase, putative  25.98 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  30.39 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  27.84 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  34.33 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  27.46 
 
 
437 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>