More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0218 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  74.38 
 
 
485 aa  738    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  100 
 
 
543 aa  1108    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  49.56 
 
 
466 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  48.76 
 
 
468 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  45.78 
 
 
463 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  48.28 
 
 
461 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  45.97 
 
 
526 aa  346  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  45.24 
 
 
477 aa  342  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  45 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  44.42 
 
 
447 aa  333  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  45.74 
 
 
440 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  49.18 
 
 
468 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  44.16 
 
 
444 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  44.63 
 
 
444 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  45.9 
 
 
443 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 
448 aa  329  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.29 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  46.44 
 
 
450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  43.96 
 
 
460 aa  324  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.51 
 
 
470 aa  323  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  46.46 
 
 
515 aa  319  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  41.06 
 
 
508 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  44.69 
 
 
515 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.02 
 
 
464 aa  316  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  40.76 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  42.19 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  42.98 
 
 
487 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  41.2 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  41.98 
 
 
471 aa  306  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  44.99 
 
 
448 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  45.37 
 
 
467 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  45.14 
 
 
467 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  45.14 
 
 
467 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  41.67 
 
 
445 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  44.47 
 
 
471 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  40.69 
 
 
471 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.17 
 
 
517 aa  276  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  36.64 
 
 
443 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 
431 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  36.72 
 
 
431 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  29.88 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.55 
 
 
429 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.18 
 
 
432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.79 
 
 
440 aa  216  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.84 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.62 
 
 
433 aa  213  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.39 
 
 
441 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.62 
 
 
433 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
434 aa  210  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.62 
 
 
433 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.62 
 
 
433 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.62 
 
 
433 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.62 
 
 
433 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.62 
 
 
433 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.38 
 
 
433 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.91 
 
 
433 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  30.57 
 
 
428 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.91 
 
 
433 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.61 
 
 
424 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.45 
 
 
447 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  34.97 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  32.41 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 
438 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
461 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  32.8 
 
 
424 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
431 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
431 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.76 
 
 
424 aa  193  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.6 
 
 
427 aa  193  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.32 
 
 
451 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
459 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  31 
 
 
429 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  30.99 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  29.83 
 
 
413 aa  191  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 
424 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 
424 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  34.69 
 
 
404 aa  190  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 
435 aa  189  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  38.79 
 
 
428 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 
437 aa  189  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  32.8 
 
 
434 aa  188  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
436 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  31.31 
 
 
416 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.24 
 
 
428 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  35.36 
 
 
437 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  30.61 
 
 
407 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 
428 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  31.79 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.82 
 
 
847 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.17 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.89 
 
 
466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  32.1 
 
 
435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  28.47 
 
 
435 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
421 aa  183  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  35.91 
 
 
425 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.22 
 
 
457 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.59 
 
 
422 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 
422 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  30.93 
 
 
439 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>