More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3058 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  100 
 
 
435 aa  872    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1310  FolC bifunctional protein  47.11 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000982097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  43.76 
 
 
444 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0483  FolC bifunctional protein  40.41 
 
 
492 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  hitchhiker  0.00144765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  41 
 
 
413 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  39.35 
 
 
407 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.28 
 
 
441 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  29.82 
 
 
441 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.43 
 
 
424 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.99 
 
 
424 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
425 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  35.46 
 
 
424 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 
433 aa  178  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
437 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  34.85 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 
434 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.24 
 
 
427 aa  172  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
404 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  35.26 
 
 
422 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.67 
 
 
457 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  29.21 
 
 
429 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 
423 aa  169  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
424 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  36.73 
 
 
403 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.83 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  29.22 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  34.16 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.24 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  32.17 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.98 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  32.39 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  28.86 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  32.1 
 
 
442 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
432 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
459 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
442 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.77 
 
 
433 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
436 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
436 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.05 
 
 
422 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
440 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  31.91 
 
 
410 aa  161  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
878 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  30.79 
 
 
543 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0733  folylpolyglutamate synthase  28.9 
 
 
441 aa  160  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.136275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  31.03 
 
 
438 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  32.09 
 
 
436 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  28.85 
 
 
425 aa  159  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  35.34 
 
 
381 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  28.5 
 
 
413 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  29.67 
 
 
433 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  33.91 
 
 
441 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.71 
 
 
464 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  34.11 
 
 
442 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  29.03 
 
 
443 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  31.86 
 
 
436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.49 
 
 
466 aa  157  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  31.86 
 
 
436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  30.53 
 
 
485 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  36.44 
 
 
428 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  31.86 
 
 
436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  32.56 
 
 
453 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  35.13 
 
 
440 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.31 
 
 
433 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  34.9 
 
 
444 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  28.6 
 
 
433 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 
431 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  28.31 
 
 
433 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  28.31 
 
 
433 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  28.31 
 
 
433 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.86 
 
 
433 aa  156  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 
474 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  34.37 
 
 
437 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  32.09 
 
 
436 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  29.22 
 
 
419 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
440 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
441 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
441 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
452 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  32.49 
 
 
404 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  28.86 
 
 
382 aa  155  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  39.05 
 
 
408 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.18 
 
 
408 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  29.36 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  27.27 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 
414 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
444 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 
447 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  34.03 
 
 
441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  34.1 
 
 
441 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  27.59 
 
 
432 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 
468 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  38.76 
 
 
408 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  29.9 
 
 
426 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  35.38 
 
 
441 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1084  folylpolyglutamate synthetase, putative  27.31 
 
 
450 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.32 
 
 
428 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  32.76 
 
 
448 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
436 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>