More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0464 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  74.38 
 
 		 543 aa  738    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  100 
 
 		 485 aa  988    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  48.8 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  52.02 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  47.43 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  47.64 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  47.96 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  47.65 
 
 		 526 aa  356  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  47.57 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  44.02 
 
 		 471 aa  333  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  44.3 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  44.1 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  46.21 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  43.14 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.42 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  44.02 
 
 		 460 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  46.86 
 
 		 468 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.05 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  44.74 
 
 		 515 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.7 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  43.27 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  44.2 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  42.16 
 
 		 447 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  41.27 
 
 		 508 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  43.48 
 
 		 448 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  41.72 
 
 		 487 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  43.48 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  41.12 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  39.78 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  43.23 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  43.01 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  43.01 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  46.56 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  41.44 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  41.97 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.34 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.7 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.7 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.78 
 
 		 441 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.8 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.18 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.41 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.95 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 432 aa  220  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  32.95 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  32.95 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  32.95 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  32.71 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.71 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.95 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.02 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 		 431 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  31.32 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.38 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  32.16 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  36 
 
 		 878 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.39 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  37.08 
 
 		 431 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  31.25 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.66 
 
 		 428 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.32 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.57 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.81 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 		 424 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  32.73 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  31.51 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.58 
 
 		 427 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  38.36 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  31.07 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  31.41 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.01 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  33.24 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  31.98 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.43 
 
 		 466 aa  187  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  30.41 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.14 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  31.67 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  38.12 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  31.21 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  31.41 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  31.11 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  34.95 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>