More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1042 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1042  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  100 
 
 		 389 aa  785    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1231  folC bifunctional protein  53.59 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1106  folC bifunctional protein  53.59 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0635  folC bifunctional protein  52.82 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0713  putative periplasmic protein  46 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0077  valyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0471  folylpolyglutamate synthase  45.12 
 
 		 391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0734  folylpolyglutamate synthase  43.28 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00291399  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1569  folylpolyglutamate synthetase  40.66 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1616  FolC bifunctional protein  41.18 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  26.88 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  28.69 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  29.9 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.46 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  28.65 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  29.87 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  29.03 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  29.03 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  29.13 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  28.65 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  28.76 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  29.3 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  28.76 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  31.5 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  30.53 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  28.76 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  27.93 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  28.49 
 
 		 423 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.02 
 
 		 422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  31.43 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  30.32 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  30.15 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  29.3 
 
 		 485 aa  126  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.32 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  28.68 
 
 		 436 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  27.94 
 
 		 442 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.43 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0759  FolC bifunctional protein  26.84 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0577538  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  30.67 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  29.16 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  27.78 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.69 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  27.88 
 
 		 425 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  28.94 
 
 		 435 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  27.5 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  29.9 
 
 		 813 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.47 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  30.08 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  28.68 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.69 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.6 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  28.79 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.47 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.43 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  32.13 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.69 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.43 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  28.94 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  29.65 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  27.74 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  30.03 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  28.12 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.82 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  27.15 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  27.69 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  28.23 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.21 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  30.21 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.21 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  29.28 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  29.37 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  30.21 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.21 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  28.79 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  27.44 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  27.02 
 
 		 847 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.95 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  27.52 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.21 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  28.76 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  29.17 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  29.3 
 
 		 407 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  27.94 
 
 		 448 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.45 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.79 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  27.65 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  29.04 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1331  FolC bifunctional protein  29.14 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  28.07 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.47 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.96 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  27.11 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  30.37 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  29.18 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  28.27 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  29.78 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.45 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>