More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2076 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2076  dihydrofolate synthase  100 
 
 
427 aa  865    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.59 
 
 
422 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.81 
 
 
422 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.39 
 
 
422 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.57 
 
 
422 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.05 
 
 
434 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.98 
 
 
422 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.06 
 
 
422 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.05 
 
 
434 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.05 
 
 
434 aa  279  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.16 
 
 
422 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.16 
 
 
422 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.16 
 
 
422 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.3 
 
 
420 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  39.1 
 
 
422 aa  272  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  272  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  39.1 
 
 
422 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  36.64 
 
 
431 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.1 
 
 
422 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  36.97 
 
 
432 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  36.97 
 
 
432 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  36.73 
 
 
432 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  36.21 
 
 
421 aa  269  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  35.66 
 
 
448 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.79 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 
430 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  37.59 
 
 
423 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  37.59 
 
 
423 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
423 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
423 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 
423 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.77 
 
 
421 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  36.1 
 
 
425 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  37.56 
 
 
428 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1156  FolC bifunctional protein  36.64 
 
 
429 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.482088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  36.93 
 
 
421 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0758  FolC bifunctional protein  37.56 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000171219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  37.08 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  37.11 
 
 
420 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  36.18 
 
 
429 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  36.71 
 
 
406 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 
423 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  36.47 
 
 
434 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  36.56 
 
 
416 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  36.56 
 
 
416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.39 
 
 
422 aa  245  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  38.67 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02507  folylpolyglutamate synthase; dihydrofolate synthase  37.47 
 
 
432 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  39.11 
 
 
411 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.65 
 
 
434 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 
437 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  36.95 
 
 
437 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1555  FolC bifunctional protein  37.59 
 
 
438 aa  239  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282101  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
432 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0435  folylpolyglutamate synthetase/dihydrofolate synthase  34.94 
 
 
455 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  37.04 
 
 
429 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  36.69 
 
 
418 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  35.75 
 
 
432 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  36.34 
 
 
435 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  37.04 
 
 
433 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 
437 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  38.41 
 
 
440 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
436 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  43.75 
 
 
386 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0470  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
457 aa  235  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  37.35 
 
 
448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  36.03 
 
 
428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  35.8 
 
 
426 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  36.3 
 
 
436 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
437 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 
425 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  36.96 
 
 
440 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
435 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 
437 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.69 
 
 
432 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  36.85 
 
 
432 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 
426 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  36.82 
 
 
436 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
428 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  35.84 
 
 
436 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.81 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.35 
 
 
443 aa  226  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  34.02 
 
 
443 aa  225  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  35.97 
 
 
436 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  35.97 
 
 
436 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 
436 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 
436 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  35.29 
 
 
436 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1331  FolC bifunctional protein  39.16 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  36.94 
 
 
441 aa  223  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>