More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1156 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1156  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 429 aa  871    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.482088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  41.01 
 
 		 430 aa  299  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  42.34 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  40.05 
 
 		 432 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  40.78 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  40.96 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  39.82 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  39.82 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  38.81 
 
 		 432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.03 
 
 		 431 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1555  FolC bifunctional protein  43.29 
 
 		 438 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  40.18 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  39.81 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  40.62 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  39.81 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  37.62 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  41.13 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  38.13 
 
 		 431 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  39.3 
 
 		 441 aa  276  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  40.9 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  41.18 
 
 		 441 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  39.67 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  40.14 
 
 		 441 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  41.27 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  40.62 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.47 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.05 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.88 
 
 		 422 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  40.43 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.23 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  41.36 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  40.14 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  38.9 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  39.23 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  40.14 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  38.82 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.88 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.23 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  39.56 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  41.04 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.23 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  37.17 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  38.04 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  38.28 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.02 
 
 		 422 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  38.37 
 
 		 435 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  37.17 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  40.52 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  39.1 
 
 		 435 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  40 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  38.72 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  40 
 
 		 423 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  39.33 
 
 		 429 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  40.38 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  40.38 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  40.29 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  41.45 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  38.97 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  38.3 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.15 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  40.52 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.44 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.44 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.04 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2076  dihydrofolate synthase  36.64 
 
 		 427 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  40.75 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  38.03 
 
 		 421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  39.45 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  39.39 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.22 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  39.22 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  38.07 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.22 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  37.05 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  38.3 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  37.41 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.36 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.39 
 
 		 421 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.12 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  39.18 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>