40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3597 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  100 
 
 
338 aa  651    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  43.02 
 
 
357 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  44.85 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  40.06 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  45.99 
 
 
346 aa  232  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  42.64 
 
 
344 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  40.63 
 
 
364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  40.92 
 
 
364 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  36.99 
 
 
357 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  37.07 
 
 
353 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  35.35 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  35.35 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  35.35 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  35.05 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  35.05 
 
 
337 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  35.05 
 
 
337 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  35.05 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  35.05 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  35.05 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  35.05 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  35 
 
 
337 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  28.82 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  23.74 
 
 
376 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  27.81 
 
 
351 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  27.81 
 
 
351 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  36.13 
 
 
321 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  23.85 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  26.45 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  28.61 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  28.74 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  28.74 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  25.99 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  30.32 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  29 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  29.51 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  30.16 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  28.19 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0152  regulatory protein pfoR  33.33 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.021711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0078  perfringolysin O regulator protein  37.84 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>