27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0078 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0078  perfringolysin O regulator protein  100 
 
 		 342 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0300  regulatory protein PfoR  86.09 
 
 		 343 aa  524  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.503963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0293  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  86.09 
 
 		 343 aa  524  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1819  perfringolysin O regulator protein  58.24 
 
 		 340 aa  374  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000327403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0152  regulatory protein pfoR  55.75 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0155  hypothetical protein  55.75 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.021711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3882  membrane protein PfoR  56.83 
 
 		 345 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2836  putative regulatory protein  61.19 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1056  regulatory protein pfoR  55.28 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.630661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5065  membrane protein; regulatory protein  57.91 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5459  membrane protein PfoR  57.91 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1244  hypothetical protein  55.59 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5489  membrane protein PfoR  57.59 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5461  membrane protein PfoR  57.91 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5217  membrane protein PfoR  57.59 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5615  membrane protein PfoR  57.59 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5497  membrane protein PfoR  58.71 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5162  membrane protein PfoR  58.23 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5546  membrane protein PfoR  58.71 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5049  membrane protein; regulatory protein  57.28 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  49.08 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2556  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  42.65 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2608  regulatory protein PfoR  42.65 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2096  perfringolysin O regulator protein, putative  41.4 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0243  regulatory protein PfoR  46.2 
 
 		 687 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  33.71 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  41.82 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>