23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1755 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  100 
 
 
412 aa  802    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  38.11 
 
 
352 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  37.9 
 
 
349 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  36.32 
 
 
351 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  36.32 
 
 
351 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  38.54 
 
 
356 aa  192  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  31.12 
 
 
352 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  37.07 
 
 
352 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  30.55 
 
 
353 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  30.55 
 
 
353 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  30.19 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  31.16 
 
 
321 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  26.96 
 
 
357 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  25.07 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  25.76 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  30.86 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  31.98 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  25.78 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  26.1 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0692  regulatory protein, putative  29.03 
 
 
193 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.523843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  28.41 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  26.06 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  26.35 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>