46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  100 
 
 		 357 aa  691    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  72.21 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  51.58 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  48.98 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  47.7 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  42.5 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  41.76 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  41.93 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  37.57 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  42.29 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  35.88 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  35.69 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  35.4 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  35.4 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  35.4 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  35.63 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  35.63 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  35.1 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  30.98 
 
 		 369 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  35.45 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  31.03 
 
 		 352 aa  93.2  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  29.1 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  29.1 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  25.39 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  29.77 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  29.77 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  26.51 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  29.95 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  31.22 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  30.71 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  30.71 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  29.21 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  30.2 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  28.92 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5049  membrane protein; regulatory protein  28.09 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5461  membrane protein PfoR  28.89 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5162  membrane protein PfoR  29.09 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3882  membrane protein PfoR  26.97 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5065  membrane protein; regulatory protein  27.84 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5546  membrane protein PfoR  28.62 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5489  membrane protein PfoR  28.62 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5459  membrane protein PfoR  27.84 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5497  membrane protein PfoR  28.62 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2096  perfringolysin O regulator protein, putative  26.17 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>