35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1947 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  100 
 
 
353 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  100 
 
 
353 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  74.86 
 
 
352 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  39.43 
 
 
352 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  39.83 
 
 
351 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  39.83 
 
 
351 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  41.95 
 
 
352 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  39.43 
 
 
349 aa  225  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  37.46 
 
 
356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  39.6 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  33.72 
 
 
352 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  30.65 
 
 
412 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  28.74 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0692  regulatory protein, putative  33.73 
 
 
193 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.523843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  33.33 
 
 
357 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  32.08 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  30.56 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  29.46 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  25.64 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  28.09 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  31.65 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  31.96 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  26.58 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  30.71 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  28.07 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  28.24 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  28.24 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  28.24 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  28.24 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  28.24 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  28.24 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  28.24 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  28.24 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  27.91 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  27.91 
 
 
337 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>