37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0650 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  678    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  59.64 
 
 
333 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  55.43 
 
 
346 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  45.6 
 
 
357 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  51.72 
 
 
357 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  47.59 
 
 
353 aa  249  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  42.26 
 
 
338 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  41.38 
 
 
364 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  40.11 
 
 
364 aa  225  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  39.45 
 
 
364 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  31.95 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  31.36 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  31.36 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  31.07 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  31.07 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  31.36 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  32.21 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  31.82 
 
 
352 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  25.8 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  28.26 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  27.41 
 
 
380 aa  84  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  28.57 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  27.58 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  31.46 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  30.37 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  30.56 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  30.56 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  32.03 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  25.76 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  27.18 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  27.18 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  24.48 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  29.89 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>