35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2141 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  100 
 
 		 352 aa  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  78.69 
 
 		 351 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  78.69 
 
 		 351 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  46.49 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  46.49 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  41.83 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  39.43 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  39.43 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  37.86 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  38.11 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  36.16 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  31.14 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  28.82 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  27.51 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0692  regulatory protein, putative  35.43 
 
 		 193 aa  96.3  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.523843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  30.59 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  28.44 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  29.96 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  29.1 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  27.95 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  24.66 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  27.61 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  27.61 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  27.61 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  27.95 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  26.03 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  24.79 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  25.36 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  24.23 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  25.48 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>