35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1792 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  100 
 
 
376 aa  733    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  52.68 
 
 
369 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  42.98 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  38.94 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  38.94 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  38.94 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  38.94 
 
 
337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  38.66 
 
 
337 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  38.66 
 
 
337 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  38.66 
 
 
337 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  38.66 
 
 
337 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  38.66 
 
 
337 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  38.66 
 
 
337 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  39.5 
 
 
337 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  27.47 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  23.74 
 
 
338 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  28.46 
 
 
344 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  27.65 
 
 
357 aa  96.3  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  28.8 
 
 
364 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  28.09 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  27.08 
 
 
333 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  25.86 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  26.28 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  27.16 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  27.89 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  23.84 
 
 
412 aa  59.7  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  23.79 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  23.79 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  24.35 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  26.07 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  24.93 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  24.06 
 
 
349 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  24.87 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  30 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  30 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>