34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1284 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  100 
 
 
349 aa  671    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  46.49 
 
 
352 aa  299  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  48.28 
 
 
351 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  48.28 
 
 
351 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  47.03 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  52.15 
 
 
352 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  41.45 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  39.43 
 
 
353 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  39.43 
 
 
353 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  37.9 
 
 
412 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  34.76 
 
 
321 aa  153  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  32.07 
 
 
352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  33.78 
 
 
357 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  29 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0692  regulatory protein, putative  36.52 
 
 
193 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.523843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  33.87 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  28.39 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  30.99 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  27.49 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  27.78 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  27.49 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  27.49 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  27.49 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  27.49 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  27.49 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  27.19 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  27.19 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  29.15 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  27.49 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  32.73 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  33.33 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  26.46 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  23.98 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  26.76 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>