36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1944 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  100 
 
 		 364 aa  700    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  97.8 
 
 		 364 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  75.55 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  45.35 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  40.63 
 
 		 338 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  42.94 
 
 		 333 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  39.45 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  41.19 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  40.51 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  38.67 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  37.68 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  37.39 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  37.39 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  37.39 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  37.11 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  37.11 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  37.39 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  36.83 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  37.11 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  37.11 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  36.93 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  30.56 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  28.8 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  29.15 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  32.27 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  28.31 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  30.58 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  36.13 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  32.63 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  33.33 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  28.49 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  28.49 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  31.65 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  31.65 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  33.16 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  34.56 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>