34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1352 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  695    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  47.18 
 
 
352 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  47.03 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  41.83 
 
 
352 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  41.78 
 
 
351 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  41.78 
 
 
351 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  36.89 
 
 
352 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  37.46 
 
 
353 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  37.46 
 
 
353 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  38.54 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  36.21 
 
 
321 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  31.23 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0692  regulatory protein, putative  37.08 
 
 
193 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.523843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  26.86 
 
 
338 aa  87  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  35.21 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  25 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  30.28 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  32.03 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  33.02 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  33.5 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  28.09 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  27.73 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  28.15 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  28.15 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  28.15 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  28.15 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  27.73 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  27.73 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  27.73 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  27.73 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  30.29 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  27.31 
 
 
337 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  29.58 
 
 
380 aa  52  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  25.63 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>