36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1836 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  100 
 
 
352 aa  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  44.69 
 
 
321 aa  251  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  36.1 
 
 
352 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  33.72 
 
 
353 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  33.72 
 
 
353 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  31.14 
 
 
352 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  32.07 
 
 
349 aa  138  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  31.65 
 
 
351 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  31.65 
 
 
351 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  30.19 
 
 
412 aa  126  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  31.23 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  31.81 
 
 
352 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  31.82 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  28.61 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  30.42 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  31.51 
 
 
364 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  31.46 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  32.73 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  32.27 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  30.2 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0692  regulatory protein, putative  29.82 
 
 
193 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.523843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  32.7 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  27.27 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  26.67 
 
 
376 aa  62.8  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  32.61 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  28.96 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  25.83 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  25.83 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  25.83 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  25.83 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  25.83 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  34.21 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>