36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2237 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2237  putative toxin regulator PfoR  100 
 
 
364 aa  701    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1944  toxin regulator pfoR  97.8 
 
 
364 aa  649    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.737194  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2346  membrane protein putative toxin regulator-like protein  74.18 
 
 
364 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.143914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3731  phosphotransferase system, EIIC  45.35 
 
 
357 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000282587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  40.92 
 
 
338 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  40.11 
 
 
344 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  42.94 
 
 
333 aa  237  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  41.26 
 
 
346 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02440  predicted membrane protein, putative toxin regulator  40.86 
 
 
357 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1888  PfoR protein  38.4 
 
 
353 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4867  hypothetical protein  36.86 
 
 
337 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5239  hypothetical protein  36.86 
 
 
337 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5139  hypothetical protein  36.83 
 
 
337 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000642874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4707  regulatory protein  36.57 
 
 
337 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.488826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5141  hypothetical protein  36.57 
 
 
337 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5105  hypothetical protein  36.57 
 
 
337 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0101  hypothetical protein  36.57 
 
 
337 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4722  regulatory protein  36.57 
 
 
337 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4825  hypothetical protein  36.83 
 
 
337 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.222627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5134  hypothetical protein  36.29 
 
 
337 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0374396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3590  hypothetical protein  36.29 
 
 
337 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121509  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1582  membrane protein putative toxin regulator-like protein  29.11 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000959585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1469  membrane protein, putative toxin regulator  29.45 
 
 
380 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.141534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1792  membrane protein, putative toxin regulator  28.01 
 
 
376 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000252316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1836  membrane protein, putative toxin regulator  32.73 
 
 
352 aa  90.1  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.114895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0363  membrane protein, putative toxin regulator  30.17 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2141  regulatory protein, putative  28.77 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1284  membrane protein putative toxin regulator-like protein  32.73 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1352  hypothetical protein  35.48 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0530116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1396  PTS system, IIC component, putative  32.11 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2647  hypothetical protein  29.57 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2592  hypothetical protein  29.57 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1947  phosphotransferase system EIIC  31.96 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1913  phosphotransferase system, EIIC  31.96 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000928042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1755  membrane protein, putative toxin regulator  30.22 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0787  hypothetical protein  33.94 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>