29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1868 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  100 
 
 		 343 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3882  membrane protein PfoR  49.71 
 
 		 345 aa  292  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5162  membrane protein PfoR  51.08 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5489  membrane protein PfoR  51.08 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0155  hypothetical protein  47.37 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.021711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0152  regulatory protein pfoR  47.37 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5497  membrane protein PfoR  50.77 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5546  membrane protein PfoR  50.77 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5461  membrane protein PfoR  50.77 
 
 		 345 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5459  membrane protein PfoR  50.15 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5065  membrane protein; regulatory protein  50.15 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5217  membrane protein PfoR  49.85 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5049  membrane protein; regulatory protein  49.85 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5615  membrane protein PfoR  49.85 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1244  hypothetical protein  48.45 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1056  regulatory protein pfoR  48.14 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.630661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1819  perfringolysin O regulator protein  46.88 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000327403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0293  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  49.69 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0300  regulatory protein PfoR  49.69 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.503963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2836  putative regulatory protein  48.37 
 
 		 347 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0078  perfringolysin O regulator protein  49.08 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2096  perfringolysin O regulator protein, putative  35.17 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2608  regulatory protein PfoR  35.74 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2556  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  35.74 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0243  regulatory protein PfoR  38.86 
 
 		 687 aa  140  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3597  PfoR protein  29.64 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2149  putative PTS system, EIIc component  31.49 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0650  hypothetical protein  29.89 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000543159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1526  PfoR protein  33.72 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>