25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0243 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0243  regulatory protein PfoR  100 
 
 
687 aa  1398    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0155  hypothetical protein  46.81 
 
 
343 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.021711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0152  regulatory protein pfoR  46.81 
 
 
343 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1244  hypothetical protein  48.4 
 
 
355 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1056  regulatory protein pfoR  48.4 
 
 
355 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.630661  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0300  regulatory protein PfoR  47.87 
 
 
343 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.503963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0293  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  47.87 
 
 
343 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0078  perfringolysin O regulator protein  46.55 
 
 
342 aa  159  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1819  perfringolysin O regulator protein  44.02 
 
 
340 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000327403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5461  membrane protein PfoR  42.78 
 
 
345 aa  144  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5459  membrane protein PfoR  42.78 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5162  membrane protein PfoR  42.78 
 
 
345 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2836  putative regulatory protein  42.06 
 
 
347 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5065  membrane protein; regulatory protein  42.78 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5546  membrane protein PfoR  42.78 
 
 
345 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5489  membrane protein PfoR  42.78 
 
 
345 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5497  membrane protein PfoR  42.78 
 
 
345 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1868  perfringolysin O regulator protein  38.86 
 
 
343 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5049  membrane protein; regulatory protein  42.25 
 
 
345 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5615  membrane protein PfoR  42.25 
 
 
345 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5217  membrane protein PfoR  42.25 
 
 
345 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3882  membrane protein PfoR  41.18 
 
 
345 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2096  perfringolysin O regulator protein, putative  35.64 
 
 
347 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2556  phosphotransferase system fructose-specific IIC component-like protein  36.56 
 
 
347 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2608  regulatory protein PfoR  36.56 
 
 
347 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>